La carrera de Ingeniería industrial se creo en 1980 con el propósito de ofrecer a la región un programa de formación de ingenieros de alta calidad que contribuyeran al desarrollo regional, en los ámbitos industrial, empresarial, público y privado.

En diciembre de 1998 la Carrera obtuvo su Acreditación de Alta Calidad, válida por cinco años, por medio de la Resolución 3591 del Ministerio de Educación Nacional, con lo cual se constituyó en el primer programa de Ingeniería Industrial acreditado en el Suroccidente Colombiano.

Hasta la fecha han egresado cerca de 2800 ingenieros industriales de la Javeriana de Cali, quienes se desempeñan con éxito apreciable en organizaciones de los sectores de manufactura y servicios, tanto públicos como privados,

La Reacreditación de Alta Calidad del programa se obtuvo por medio de la Resolución 747 del 9 de marzo de 2005, válida por siete años.