La oficina de Contabilidad y Presupuesto es la encargada de la elaboración, dirección y vigilancia del área contable de la Seccional según las normas legales y en coordinación con la oficina de Contabilidad de la sede de Bogotá. También le compete el estudio de la efectiva asignación de los recursos económicos de la Seccional a través del presupuesto y el control de ejecución, según las políticas del Consejo de la Seccional.