Modelado y simulación
Análisis de perfiles de metilación, de genómas, de redes metabólicas y proteicas, a la anotación de genes asociados con rasgos agronómicos de interés, al descubrimiento de relaciones estructura-función desde la escala molecular (desde compuestos químicos básicos, hasta redes metabólicas y proteicas), a la predicción de estructuras terciarias e identificación de rutas de señalización de estreses en proteínas de membrana, y a la simulación de primeros principios físico químicos de materiales y compuestos orgánicos para reducir el costo del desarrollo de sensores para biomarcadores plantares (metabolómica dirigida).
Contamos con equipos de última generación y personal altamente capacitado para prestar servicios tales como:
| Servicio | Descripción |
| Modelado y simulación de primeros principios de sistemas biomoleculares y materiales | Desde la mecánica cuántica (con paquetes como VASP, ADF, Quantum Espresso, ATK, Jaguar, entre otros) hasta aproximaciones atomísticas (con paquetes como LAMMPS, Gromacs, NAMD, Desmond, entre otros) y de grano grueso en análisis conformacional de proteínas y macromoléculas, análisis cinético y dinámico de reacciones químicas y estados electrónicos excitados. |
| Predicción y análisis de estructura terciaria y rutas de señalización de proteínas de membrana | A partir de secuencias primarias, empleando metodologías de dinámica molecular y metadinámica desarrolladas por miembros nacionales e internacionales del equipo Ómicas. |
| Anotación de genes a partir de datos fenotípicos y genomas secuenciados | |
| Predicción de puntos de recombinación a partir de duplas de genomas parentales | |
| Optimización de campos de fuerza complejos (covalentes y reactivos) | Empleando herramientas semi-automáticas desarrolladas por miembros del equipo Ómicas (empleando paquetes como ADF, GARFfield, entre otros) para múltiples aplicaciones en materiales blandos y duros. |
| Cursos especializados en modelamiento de materiales y sistemas biológicos |
* Las condiciones de todos los servicios pueden variar según los requerimientos del cliente.
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